Η Ακαδημία Μπάσκετ της Α.Ε. Κοζάνης ιδρύθηκε το 2002 καί είναι η μεγαλύτερη σε αριθμό παιδιών ακαδημία της Δυτικής Μακεδονίας.
Στα αγόρια η Ακαδημία της ΑΕΚ συμπεριλαμβάνει πέντε τμήματα Μίνι (ηλικίες 7-12 ετών), δύο τμήματα Προπαιδικού (ηλικίες 13-14 ετών), το τμήμα Παιδικού (15-16 ετών) καθώς καί το Εφηβικό Τμήμα (17-18 ετών). Οι παίκτες τού Εφηβικού Τμήματος αγωνίζονται καί στο ανδρικό πρωτάθλημα της Α' Κατηγορίας της Ενωσης Καλαθοσφαιρικών Σωματείων Δυτικής Μακεδονίας (Ε.ΚΑ.Σ.ΔΥ.Μ).
Η ομάδα Παίδων της ΑΕΚ κατέκτησε το Παιδικό Πρωτάθλημα της Ε.ΚΑ.Σ.ΔΥ.Μ. τις τρείς τελευταίες σαιζόν (2009-10, 2008-09, 2007-08).
Στα κορίτσια η Ακαδημία Μπάσκετ της ΑΕΚ συμπεριλαμβάνει το τμήμα Μίνι (7-13 ετών) καθώς καί το τμήμα Κορασίδων (14-15 ετών).
Η Ακαδημία Μπάσκετ της Α.Ε.Κ. στηρίζεται στούς έμπειρους προπονητές Κώστα Μαυροζούμη, Δημήτρη Σιακαβάρα και Γιάννη Γκουντιό.
Οι προπονήσεις των τμημάτων Μίνι γίνονται κάθε Σάββατο καί Κυριακή στο Βαλταδώρειο Γυμνάσιο από τις 11 το πρωϊ (αγόρια) καί στο Κλειστό Αγίου Νικάνορα (Σκρ'κα) από τις 4 το απόγευμα (κορίτσια).
Τα τμήματα Παίδων, Εφήβων καί Κορασίδων προπονούνται στη διάρκεια της εβδομάδας στο Κλειστό της Οδού Βερμίου.
